Tato stavba funguje jako podzemní bunkr s válečnou místností a slouží pro plánování a provádění tajných operací. Většina informací zde uložených nese označení „Přísně tajné“, což z této stavby dělá spolu s Command Centrem [...] oblíbený cíl zlodějů dat. Provádí se zde příprava Ghostů [...] a vyrábějí se zde některé speciální technologie pro jejich skafandry jako optika, reaktor [...], maskovací zařízení [...] a uzamykací střely [...]. Budova CovertOps musí být připojena k Science Facility [...].